근로자의 봉급에 대한 세금은 매월 월급을 줄 때 그 소속기관이나 사업자(원천징수의무자)가 우선 원천징수하고, 전년도 1년분의 정확한 세금을 따져 다음 해 2월에 실제 부담할 세액을 정산하게 된다. 근로자는 연말정산을 하려면 소득·세액 공제 항목 관련 영수증과 증빙서류를 미리 준비하여 '소득공제 신고서'와 함께 사업자(원천징수의무자)에게 제출하여야 한다. 사업자(원천징수의무자)는 다음 해 1월 말까지 일괄적으로 근로자의 연말정산을 일괄처리하여 관할 세무서에 제출해야 한다. 각종 공제 항목은 해마다 조금씩 변경되므로 해당 연도에 항목을 확인할 필요가 있다.

1. 절차

'총급여액'에서 비과세소득을 빼고, 근로소득공제를 하면 '근로소득금액'이 나온다. 여기서 각종 소득공제를 하면 '과세표준' 금액이 나온다. 각종 소득공제에는 인적공제(본인, 배우자, 부양가족 등), 특별공제(보험료, 의료비, 교육비, 주택자금, 기부금 등), 연금보험료공제, 기타 소득공제(연금저축소득공제, 신용카드 소득공제, 투자조합출자 소득공제 등) 등이 있다. 그리고 이 과세표준에 세율을 곱해 산출세액을 구하고 여기에 다시 세액공제를 하면 '결정세액'이 나온다. 이미 납부한 세금과 결정세액을 비교하여 기납부세액이 더 많으면 그만큼을 환급받게 되며, 기납부세액이 더 적으면 그만큼을 납부해야 한다. 현재 국세청에서는 좀더 손쉬운 연말정산을 위하여 '연말정산간소화서비스'를 운영 중이다.

2. 연말정산 시기

 연말정산 시기는 연도 중에 퇴직하는 경우 퇴직하는 달의 급여를 지급하는 때에 한다. (※ 회사는 퇴직 근로자에 대해 연말정산을 하고 원천징수영수증을 교부하여야 한다.) 계속 근로자의 경우에는 다음 해 2월분 급여를 지급하는 때이다.

3. 주요개정사항

 - 50세 이상 연금계좌세액공제 한도 확대 : 50세이상 근로자를 대상으로 한도액이 700만원에서 900만원으로 확대됨(2020.01.01. 이후 납입분부터)
 
 - 신용카드등 상용금액 소득공제 적용기한 연장 및 신문구독료 소득공제확대 : 신문구독료에 대하여 도서·공연 등 사용분과 동일한 30% 적용함.

 - 20년 4월~7월 신용카드 사용분 소득공제율 80%로 인상 : 소득구간별 한도내의 금액만 공제 가능

4. 준비하실 서류

 - 기부금영수증(국세청 미제공분)
 - 의료비 세액공제 증명서류(안경,콘텍트렌즈 구입비용 등)
 - 월세세액 공제를 위한 증명서류(등본,임대차계약서 등)
 - 기타서류 : 국세청 홈택스 연말정산 간소화 서비스 참조